Geinspireerd op echte personen en gebeurtenissen laat Godfather of Harlem het verhaal zien van de beruchte onderwereldbaas Bumpy Johnson (Academy Award®- winnaar Forest Whitaker), die in het begin van de jaren 60 terugkeerde na tien jaar gevangenschap en ontdekte dat de wijk waar hij ooit regeerde een puinhoop was geworden. Aangezien de Italiaanse maffia over de straten heerst, mot Bumpy de strijd aangaan met de onderwereldfamilie Genovese om de macht terug te krijgen. Tijdens de wrede strijd vormt hij en alliantie met de radicale prediker Malcolm X (Nigél Thatch) - waardoor Malcolms politieke opkomst het mikpunt wordt van de sociale oproer en en maffia-oorlog de stad dreigt te verscheuren. Godfather of Harlem is en botsing van de criminele onderwereld en de burgerrechtenbeweging tijdens en tumultueuze tijd in de Amerikaanse geschiedenis. Hoewel dit verhaal is geinspireerd op echte gebeurtenissen, zijn sommige personages, karakteriseringen, gebeurtenissen, locaties en dialogen verzonnen of toegevoegd ter dramatisering. Mocht hierdoor en link kunnen worden gelegd door en naam met en echt persoon, levend of dood, of een product, entiteit of gebeurtenis, dan is het puur bedoeld ter dramatisering en niet om een beeld te schetsen over een echt persoon, product of entiteit.